Рецептор, активируемый пероксисомным пролифератором дельта

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Рецептор, активируемый пероксисомным пролифератором дельта
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1GWX, 1Y0S, 2AWH, 2B50, 2BAW, 2ENV, 2GWX, 2J14, 2Q5G, 2XYJ, 2XYW, 2XYX, 2ZNP, 2ZNQ, 3D5F, 3DY6, 3ET2, 3GWX, 3GZ9, 3OZ0, 3PEQ, 3SP9, 3TKM

Идентификаторы
ПсевдонимыPPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, peroxisome proliferator activated receptor delta
Внешние IDOMIM: 600409 MGI: 101884 HomoloGene: 4544 GeneCards: PPARD
Расположение гена (человек)
6-я хромосома человека
Хр.6-я хромосома человека[1]
6-я хромосома человека
Расположение в геноме PPARD
Расположение в геноме PPARD
Локус6p21.31Начало35,342,558 bp[1]
Конец35,428,191 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме PPARD
Расположение в геноме PPARD
Локус17 A3.3|17 14.64 cMНачало28,232,700 bp[2]
Конец28,301,474 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • skin of thigh

  • tail of epididymis

  • buccal mucosa cell

  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland

  • corpus epididymis

  • mucosa of transverse colon
Наибольшая экспрессия в
  • secondary oocyte

  • interventricular septum

  • muscle of thigh
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

5467

19015

Ensembl

ENSG00000112033

ENSMUSG00000002250

UniProt

Q03181

P35396

RefSeq (мРНК)

NM_001171818
NM_001171819
NM_001171820
NM_006238
NM_177435

NM_011145

RefSeq (белок)

NP_001165289
NP_001165290
NP_001165291
NP_006229
NP_803184

NP_035275

Локус (UCSC)Chr 6: 35.34 – 35.43 MbChr 17: 28.23 – 28.3 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Рецептор, активируемый пероксисомным пролифератором дельта (англ. Peroxisome proliferator-activated receptor delta, сокр. PPAR-δ или PPAR-β), также известный как NR1C2, представляет собой белок — ядерный рецептор, функционирующий как транскрипционный фактор, который у человека кодируется геном PPARD[5].

Этот ген кодирует один из представителей семейства рецепторов, активируемые пероксисомным пролифератором (PPAR). Впервые он был идентифицирован у лягушек Xenopus в 1993 году[6].

Полипептидная цепь белка включает в себя 441 аминокислоту, а молекулярная масса составляет — 49903 Да[7].

Выполняемые функции

[править | править код]

PPAR-дельта — это ядерный гормональный рецептор, который регулирует множество биологических процессов и может быть вовлечён в развитие ряда хронических заболеваний, включая сахарный диабет, ожирение, атеросклероз и рак[8][9].

В мышцах экспрессия гена PPARD увеличивается под воздействием физических упражнений, что приводит к повышению окислительной (жиросжигающей) способности и увеличению количества волокон I типа[10]. И PPAR-дельта, и агонисты AMPK (АМФ-активируемые протеинкиназы) считаются имитаторами физических упражнений[11]. В жировой ткани PPAR-β/δ увеличивает как окисление, так и разобщение окислительного фосфорилирования[10].

PPAR-дельта может функционировать как интегратор репрессии транскрипции и сигнализации ядерных рецепторов. Он активирует транскрипцию различных генов-мишеней, связываясь со специфическими элементами ДНК. Хорошо описанные гены-мишени PPARδ включают PDK4, ANGPTL4, PLIN2 и CD36. Экспрессия этого гена повышена в клетках колоректального рака[12]. Повышенная экспрессия может быть подавлена аденоматозом полипозной палочки (APC), белком-супрессором опухоли, участвующим в сигнальном пути APC/бета-катенин. Исследования нокаута у мышей позволили предположить роль этого белка в миелинизации мозолистого тела, пролиферации эпидермальных клеток, метаболизме глюкозы[13] и липидов[14].

Было показано, что данный белок участвует в дифференциации, депонировании липидов[15], направленном распознавании, поляризации и миграции кератиноцитов[16].

Транскриптом PPAR-δ человека.

Роль в развитии рака

[править | править код]

Исследования роли PPAR-дельта в развитии рака дали противоречивые результаты. Несмотря на некоторые противоречия, большинство исследований указывают на то, что активация PPAR-дельта может приводить к изменениям, благоприятным для прогрессирования рака[17]. PPAR-дельта способствует ангиогенезу опухоли[18].

Распределение по тканям

[править | править код]

PPAR-дельта высоко экспрессируется во многих тканях, включая толстую кишку, тонкий кишечник, печень и кератиноциты, а также в сердце, селезёнке, скелетных мышцах, лёгких, мозге и тимусе[19].

Нокаут-исследования

[править | править код]

Нокаутные мыши, лишённые лиганд-связывающего домена PPAR-дельта, жизнеспособны. Однако эти мыши меньше дикого типа как в неонатальном, так и в постнатальном периоде. Кроме того, запасы жира в гонадах мутантов меньше. Мутанты также демонстрируют повышенную эпидермальную гиперплазию при индукции TPA (12-O-Тетрадеканоилфорбол-13-ацетата)[20].

Лиганды

[править | править код]

PPAR-дельта активируется в клетке различными жирными кислотами и производными жирных кислот[8]. Примеры встречающихся в природе жирных кислот, которые связываются с PPAR-дельта и активируют его, включают арахидоновую кислоту и некоторые представители семейства метаболитов 15-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты, включая 15(S)-ГЭТЕ, 15(R)-ГЭТЕ и 15-ГПЭТЕ[21]. Было разработано несколько высокоаффинных лигандов для PPAR-дельта, включая GW501516 и GW0742, которые играют важную роль в исследованиях. В одном из исследований с использованием такого лиганда было показано, что агонизм PPARδ изменяет топливные предпочтения организма с глюкозы на липиды[22]. Первоначально агонисты PPAR-дельта считались перспективными препаратами, имитирующими физические упражнения и способными лечить метаболический синдром, но позже были получены дополнительные данные об их возможном противораковом действии[17].

Агонисты

[править | править код]

Хотя разработка препарата была прекращена из-за исследований на животных, показавших повышенный риск развития рака, GW501516 использовался в качестве препарата для повышения работоспособности[25]. Он и другие агонисты PPAR-дельта запрещены в спорте[26][27].

Взаимодействие с белками

[править | править код]

Было показано, что рецептор, активируемый пероксисомным пролифератором дельта взаимодействует с HDAC3[28][29] и NCOR2[29].

См. также

[править | править код]

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000112033 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002250 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Schmidt A, Endo N, Rutledge SJ, Vogel R, Shinar D, Rodan GA (Октябрь 1992). Identification of a new member of the steroid hormone receptor superfamily that is activated by a peroxisome proliferator and fatty acids. Molecular Endocrinology. 6 (10): 1634–1641. doi:10.1210/mend.6.10.1333051. PMID 1333051. S2CID 23506853.
  6. ↑ Krey G, Keller H, Mahfoudi A, Medin J, Ozato K, Dreyer C, Wahli W (Декабрь 1993). Xenopus peroxisome proliferator activated receptors: genomic organization, response element recognition, heterodimer formation with retinoid X receptor and activation by fatty acids. The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 47 (1–6): 65–73. doi:10.1016/0960-0760(93)90058-5. PMID 8274443. S2CID 25098754.
  7. ↑ UniProt, Q03181 (неопр.). Дата обращения: 12 декабря 2023. Архивировано 12 декабря 2023 года.
  8. ↑ 1 2 Berger J, Moller DE (2002). The mechanisms of action of PPARs. Annual Review of Medicine. 53: 409–435. doi:10.1146/annurev.med.53.082901.104018. PMID 11818483.
  9. ↑ Feige JN, Gelman L, Michalik L, Desvergne B, Wahli W (Март 2006). From molecular action to physiological outputs: peroxisome proliferator-activated receptors are nuclear receptors at the crossroads of key cellular functions. Progress in Lipid Research. 45 (2): 120–159. doi:10.1016/j.plipres.2005.12.002. PMID 16476485.
  10. ↑ 1 2 Giordano Attianese GM, Desvergne B (2015). Integrative and systemic approaches for evaluating PPARβ/δ (PPARD) function. Nuclear Receptor Signaling. 13: e001. doi:10.1621/nrs.13001. PMC 4419664. PMID 25945080.
  11. ↑ Narkar VA, Downes M, Yu RT, Embler E, Wang YX, Banayo E, et al. (Август 2008). AMPK and PPARdelta agonists are exercise mimetics. Cell. 134 (3): 405–415. doi:10.1016/j.cell.2008.06.051. PMC 2706130. PMID 18674809.
  12. ↑ Takayama O, Yamamoto H, Damdinsuren B, Sugita Y, Ngan CY, Xu X, et al. (Октябрь 2006). Expression of PPARdelta in multistage carcinogenesis of the colorectum: implications of malignant cancer morphology. British Journal of Cancer. 95 (7): 889–895. doi:10.1038/sj.bjc.6603343. PMC 2360534. PMID 16969348.
  13. ↑ Lee CH, Olson P, Hevener A, Mehl I, Chong LW, Olefsky JM, et al. (Февраль 2006). PPARdelta regulates glucose metabolism and insulin sensitivity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (9): 3444–3449. Bibcode:2006PNAS..103.3444L. doi:10.1073/pnas.0511253103. PMC 1413918. PMID 16492734.
  14. ↑ Entrez Gene: PPARD peroxisome proliferator-activated receptor delta. Дата обращения: 12 декабря 2023. Архивировано 3 июня 2020 года.
  15. ↑ Schmuth M, Haqq CM, Cairns WJ, Holder JC, Dorsam S, Chang S, et al. (Апрель 2004). Peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)-beta/delta stimulates differentiation and lipid accumulation in keratinocytes. The Journal of Investigative Dermatology. 122 (4): 971–983. doi:10.1111/j.0022-202X.2004.22412.x. PMID 15102088.
  16. ↑ Tan NS, Icre G, Montagner A, Bordier-ten-Heggeler B, Wahli W, Michalik L (Октябрь 2007). The nuclear hormone receptor peroxisome proliferator-activated receptor beta/delta potentiates cell chemotactism, polarization, and migration. Molecular and Cellular Biology. 27 (20): 7161–7175. doi:10.1128/MCB.00436-07. PMC 2168901. PMID 17682064.
  17. ↑ 1 2 Wagner N, Wagner KD (Май 2020). PPAR Beta/Delta and the Hallmarks of Cancer. Cells. 9 (5): 1133. doi:10.3390/cells9051133. PMC 7291220. PMID 32375405.
  18. ↑ Wagner KD, Du S, Martin L, Leccia N, Michiels JF, Wagner N (Декабрь 2019). Vascular PPARβ/δ Promotes Tumor Angiogenesis and Progression. Cells. 8 (12): 1623. doi:10.3390/cells8121623. PMC 6952835. PMID 31842402.
  19. ↑ Girroir EE, Hollingshead HE, He P, Zhu B, Perdew GH, Peters JM (Июль 2008). Quantitative expression patterns of peroxisome proliferator-activated receptor-beta/delta (PPARbeta/delta) protein in mice. Biochemical and Biophysical Research Communications. 371 (3): 456–461. doi:10.1016/j.bbrc.2008.04.086. PMC 2586836. PMID 18442472.
  20. ↑ Peters JM, Lee SS, Li W, Ward JM, Gavrilova O, Everett C, et al. (Июль 2000). Growth, adipose, brain, and skin alterations resulting from targeted disruption of the mouse peroxisome proliferator-activated receptor beta(delta). Molecular and Cellular Biology. 20 (14): 5119–5128. doi:10.1128/MCB.20.14.5119-5128.2000. PMC 85961. PMID 10866668.
  21. ↑ Mol. Pharmacol. 77:171-184, 2010
  22. ↑ Brunmair B, Staniek K, Dörig J, Szöcs Z, Stadlbauer K, Marian V, et al. (Ноябрь 2006). Activation of PPAR-delta in isolated rat skeletal muscle switches fuel preference from glucose to fatty acids. Diabetologia. 49 (11): 2713–2722. doi:10.1007/s00125-006-0357-6. PMID 16960684.
  23. ↑ van der Veen JN, Kruit JK, Havinga R, Baller JF, Chimini G, Lestavel S, et al. (Март 2005). Reduced cholesterol absorption upon PPARdelta activation coincides with decreased intestinal expression of NPC1L1 (PDF). Journal of Lipid Research. 46 (3): 526–534. doi:10.1194/jlr.M400400-JLR200. PMID 15604518. Архивировано (PDF) 8 марта 2019. Дата обращения: 12 декабря 2023.
  24. ↑ Hirschfield GM, Shiffman ML, Gulamhusein A, Kowdley KV, Vierling JM, Levy C, et al. (Август 2023). Seladelpar efficacy and safety at 3 months in patients with primary biliary cholangitis: ENHANCE, a phase 3, randomized, placebo-controlled study. Hepatology. 78 (2): 397–415. doi:10.1097/HEP.0000000000000395. PMC 10344437. PMID 37386786.
  25. ↑ Koh B (22 марта 2013). Anti-doping agency warns cheats on the health risks of Endurobol. The Conversation (англ.). Архивировано 4 сентября 2023. Дата обращения: 5 сентября 2023.
  26. ↑ Trevisiol S, Moulard Y, Delcourt V, Jaubert M, Boyer S, Tendon S, et al. (Июнь 2021). Comprehensive characterization of the peroxisome proliferator activated receptor-δ agonist GW501516 for horse doping control analysis. Drug Testing and Analysis. 13 (6): 1191–1202. doi:10.1002/dta.3013. PMID 33547737. S2CID 231899376.
  27. ↑ Sobolevsky T, Dikunets M, Sukhanova I, Virus E, Rodchenkov G (Октябрь 2012). Detection of PPARδ agonists GW1516 and GW0742 and their metabolites in human urine. Drug Testing and Analysis. 4 (10): 754–760. doi:10.1002/dta.1413. PMID 22977012.
  28. ↑ Franco PJ, Li G, Wei LN (Август 2003). Interaction of nuclear receptor zinc finger DNA binding domains with histone deacetylase. Molecular and Cellular Endocrinology. 206 (1–2): 1–12. doi:10.1016/S0303-7207(03)00254-5. PMID 12943985. S2CID 19487189.
  29. ↑ 1 2 Shi Y, Hon M, Evans RM (Март 2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (5): 2613–2618. Bibcode:2002PNAS...99.2613S. doi:10.1073/pnas.052707099. PMC 122396. PMID 11867749.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Рецептор,_активируемый_пероксисомным_пролифератором_дельта&oldid=148006741