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| 2000년대 |
- 2003: 김규원, 김진의
- 2004: 윤덕용,
황우석*
- 2005: 신희섭, 이재영, 유룡
- 2006: 김성훈, 황준묵, 황창규
- 2007: 권욱현, 서진석, 임지순, 최진호
- 2008: 김기문, 민계식, 송호영, 최양도
- 2009: 강석진, 서유헌, 이현순
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| 2010년대 |
- 2010: 김광수, 오우택, 한민구
- 2011: 노태원, 박승정, 백기엽
- 2012: 신성철, 윤보현
- 2013: 김빛내리, 박종일
- 2014: 권오현, 이기명
- 2015: 이용희, 정용환
- 2016: 권오준, 현택환
- 2017: 이상엽, 황규영
- 2018: 강봉균, 박진수
- 2019: 김기남, 장석복
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| 2020년대 | |
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* 황우석은 줄기세포 논문 조작 사건으로 인하여 대한민국 최고과학기술인상 공식 홈페이지에서 그 이름이 빠졌다. |
