CASC3

CASC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7
Ідентифікатори
Символи	CASC3, BTZ, MLN51, cancer susceptibility candidate 3, cancer susceptibility 3, exon junction complex subunit, CASC3 exon junction complex subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 606504 MGI: 2179723 HomoloGene: 7208 GeneCards: CASC3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • exon-exon junction complex • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерна мембрана • cytoplasmic stress granule • дендрит (нейробіологія) • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • cell projection • Рибонуклеопротеїни • U2-type catalytic step 1 spliceosome • spliceosomal complex Біологічний процес • mRNA transport • mRNA processing • intracellular mRNA localization • Сплайсинг РНК • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0015915 транспорт • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22794	192160
Ensembl	ENSG00000108349	ENSMUSG00000078676
UniProt	O15234	Q8K3W3
RefSeq (мРНК)	NM_007359	NM_138660
RefSeq (білок)	NP_031385	NP_619601
Локус (UCSC)	Хр. 17: 40.14 – 40.17 Mb	Хр. 11: 98.7 – 98.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CASC3 (англ. Cancer susceptibility 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 76 278.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADRRRQRAS		QDTEDEESGA		SGSDSGGSPL		RGGGSCSGSA		GGGGSGSLPS
QRGGRTGALH		LRRVESGGAK		SAEESECESE		DGIEGDAVLS		DYESAEDSEG
EEGEYSEEEN		SKVELKSEAN		DAVNSSTKEE		KGEEKPDTKS		TVTGERQSGD
GQESTEPVEN		KVGKKGPKHL		DDDEDRKNPA		YIPRKGLFFE		HDLRGQTQEE
EVRPKGRQRK		LWKDEGRWEH		DKFREDEQAP		KSRQELIALY		GYDIRSAHNP
DDIKPRRIRK		PRYGSPPQRD		PNWNGERLNK		SHRHQGLGGT		LPPRTFINRN
AAGTGRMSAP		RNYSRSGGFK		EGRAGFRPVE		AGGQHGGRSG		ETVKHEISYR
SRRLEQTSVR		DPSPEADAPV		LGSPEKEEAA		SEPPAAAPDA		APPPPDRPIE
KKSYSRARRT		RTKVGDAVKL		AEEVPPPPEG		LIPAPPVPET		TPTPPTKTGT
WEAPVDSSTS		GLEQDVAQLN		IAEQNWSPGQ		PSFLQPRELR		GMPNHIHMGA
GPPPQFNRME		EMGVQGGRAK		RYSSQRQRPV		PEPPAPPVHI		SIMEGHYYDP
LQFQGPIYTH		GDSPAPLPPQ		GMLVQPGMNL		PHPGLHPHQT		PAPLPNPGLY
PPPVSMSPGQ		PPPQQLLAPT		YFSAPGVMNF		GNPSYPYAPG		ALPPPPPPHL
YPNTQAPSQV		YGGVTYYNPA		QQQVQPKPSP		PRRTPQPVTI		KPPPPEVVSR
GSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, відповідь на стрес, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 doi:10.1261/rna.2155905
• Noble C.G., Song H. (2007). MLN51 stimulates the RNA-helicase activity of eIF4AIII. PLoS ONE. 2: E303—E303. PMID 17375189 doi:10.1371/journal.pone.0000303
• Bono F., Ebert J., Lorentzen E., Conti E. (2006). The crystal structure of the exon junction complex reveals how it maintains a stable grip on mRNA. Cell. 126: 713—725. PMID 16923391 doi:10.1016/j.cell.2006.08.006

Див. також

• Хромосома 17