Methanococcus
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EM-Aufnahme von Methanococcus maripaludis | ||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||
| Methanococcus | ||||||||||||
| Kluyver & van Niel 1936[1] |
Methanococcus ist eine Gattung sphärischer (kokkoider) methanogener Archaeen aus der Familie Methanococcaceae im Phylum Methanobacteriota (früher „Euryarchaeota“).[2][3][4][5] Im Jahr 1984 wurde die frühere Typusart der Gattung, M. mazei, in die Gattung Methanosarcina reklassifiziert und gleichzeitig M. vannielii als neue Typusart festgelegt.[6] Im Jahr 2002 erfolgte eine weitere Aufspaltung der Gattung durch Abspaltung hyperthermophiler Arten in die Gattung Methanocaldococcus.[A. 1] Die in der Gattung verbliebenen Spezies sind mit Ausnahme der thermophilen Art M. thermolithotrophicus alle mesophil, d. h. sie bevorzugen gemäßigte Temperaturen.
Beschreibung
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Zellen der Typusart M. vannielii sind annähernd kokkoid und variieren in einer Kultur von 0,5 bis 4,0 µm, gewöhnlich zwischen 1 und 2 µm. Sie sind oft leicht elliptisch und treten häufig paarweise auf. Manchmal ist ein Mitglied eines solchen Paares viel kleiner als das andere und ähnelt daher einer Knospe auf einer Hefezelle. Wenn die Zellen aus tiefen Agar-Kolonien entnommen werden, haben sie oft zunächst sehr verzerrte Formen, nehmen aber bald wieder eine kugelförmige Gestalt an. Der Organismus ist aktiv beweglich, die Zellen beschreiben einzeln oder paarweise eine spiralförmige Bahn. Die Zellwand hat sich als sehr empfindlich gezeigt. Mikroskopische Untersuchungen müssen beispielsweise an Nasspräparaten durchgeführt werden, da die Zellen bei der üblichen Herstellung von getrockneten, gefärbten Ausstrichen zerfallen und dann fast nicht mehr zu erkennen sind. Außerdem werden die Zellen auch durch die Zugabe von Methylcellulose (üblicherweise zur Verlangsamung der Motilität) zerstört. Tiefe Agar-Kolonien sind linsenförmig und hellbraun und haben einen Durchmesser von 0,5 bis 1,0 mm, unter dem Mikroskop erscheint die Oberfläche der Kolonie körnig.[9]
Kultivierung
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Formiat begünstigt ein gutes Wachstum M. vannielii; maximales Wachstum wurde bei einer Formiatkonzentration von 1,5 % erreicht, bei 2 bis 3 % verlangsamt sich das Wachstum und kommt bei 5 % zum Erliegen. Der Ersatz von 0,05 % NH4Cl (Ammoniumchlorid) durch 0,05 bis 0,1 % (NH4)2SO4 (Ammoniumsulfat) hatte einen leicht positiven Effekt auf das Wachstum, höhere Konzentrationen von Ammoniumsulfat wirkten hemmend. Der pH-Bereich für das Wachstum liegt zwischen 7,4 und 9,2, mit einem Optimum bei pH 8. Während der Fermentation von Natriumformiat steigt der pH-Wert tendenziell schnell an, da dadurch die relativ starke Säure Ameisensäure in Methan und die schwache Säure Kohlendioxid (Kohlensäure) umgewandelt wird.[9]
Etymologie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Der Gattungsname Methanococcus leitet sich ab von neulateinisch methanum ‚Methan‘ bzw. methano- sich auf Methan beziehend, ‚zu Methan gehörig‘; neulateinisch coccus stammt von altgriechisch κόκκος kókkos, deutsch ‚Kern‘ oder ‚Korn‘, Methanococcus verweist also auf Methankörnchen.[2]
Das Art-Epitheton ‚vannielii‘ der Typusart wurde zu Ehren von Cornelis Bernardus van Niel vorgeschlagen, der durch die Entwicklung der Kohlendioxid-Reduktionstheorie der Methanogenen die Forschung dieser Organismen maßgeblich vorangetrieben hat.[9][2]
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die hier wiedergegebene Systematik (Artenliste) der Gattung basiert auf folgenden Quellen (Stand 8. Oktober 2025):
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2]
- N – National Center for Biotechnology Information (NCBI)[3]
- G – Genome Taxonomy Database (GTDB)[4]
- W – World Register of Marine Species (WoRMS)[5]
Gattung Methanococcus Kluyver & van Niel 1936(L)[1] oder (Kluyver & van Niel, 1936) emend. Barker, 1936(W) oder (Kluyver & van Niel, 1936) emend. Barker, 1936, …, nom. cons., emend. Mah & Kuhn 1984(N)
- Spezies Methanococcus aeolicus Kendall et al. 2006(L,N) oder Kendall, Liu, Sieprawska-Lupa, Stetter, Whitman & Boone, 2006(W) [„Methanococcus aeolicus“ Schmid et al. 1984(N)]
- Stamm DSM 17508 alias Nankai-3 oder OCM 812(L,N)
- Spezies Methanococcus maripaludis Jones et al. 1984(L,N,G) oder Jones, Paynter & Gupta, 1984(W) [Methanococcus deltae Corder et al. 1988(L,N)]
- Stamm DSM 2067(L,N,G) alias ATCC 43000, JCM 10722, NBRC 101831, OCM 175 oder JJ(L,N)
- Stamm RC(L,G) alias ΔRC, ATCC 35294 oder DSM 2771 (zu M. deltae)(L)
– DSM 2771 ist in der GTDB ein von RC verschiedener Stamm - Stamm A1(G)
- Stamm A4(G)
- Stamm A5(G)
- Stamm C6(N)
- Stamm C7(N)
- Stamm C9(G)
- Stamm C11(G)
- Stamm C12(G)
- Stamm C13(G)
- Stamm C14(G)
- Stamm D1(G)
- Stamm KA1(N,G)
- Stamm OS7(N,G)
- Stamm OS7mut1(G)
- Stamm S1(G)
- Stamm S2(N,G)
- Stamm X1(N,G)
- Stamm DSM 7078(G)
- Stamm CTOTU39236(G)
- Stamm CTOTU39240(G)
- Stamm CTOTU39187(G)
- Stamm CTOTU39238(G)
- Stamm CTOTU39244(G)
- Stamm CTOTU39242(G)
- Stamm SRR1790646_concoct_42(G)
- Stamm DJKA123_ANT-F21_bin.16(G)
- Stamm Mic1c10(G)
- Stamm MIC098Bin5(G)
- Spezies Methanococcus maripaludis_A(G)
- Stamm C8(G)
- Spezies Methanococcus maripaludis_D(G)
– beim NCBI zu Methanococcus maripaludis- Stamm C5(N,G)
- Spezies „Methanococcus thermophila“ Howell & White 1997(L)
- Spezies Methanococcus vannielii Stadtman & Barker 1951(L,N,G,W)[9] (Typusart(L,G))[6]
- Stamm ATCC 35089 alias DSM 1224, JCM 13029, OCM 148(L,N) oder SB(L,N,G)
- Spezies Methanococcus voltae Balch & Wolfe 1981(L,G) oder Balch et al. 1981 emend. Ward et al. 1989(N) oder Balch, Fox, Magrum, Woses & Wolfe, 1979(W)
- Stamm OGC:70(N) alias ATCC 33273, DSM 1537, NBRC 100457, OCM 70(L,N) oder PS (Referenz)(L,N,G)
- Stamm A2(G)
- Stamm A3(N)
- Stamm C4(G)
- Spezies Methanococcus voltae_C(G)
- Stamm DSM 14649(G)
- Spezies Methanococcus voltae_D(G)
- Stamm C2(G)
- Spezies Methanococcus sp. Dex60a43(N)
- Spezies Methanococcus sp. Fe85_1_1(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc55_1(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc55_19(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc55_2(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc55_20(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc70_1(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc70_2(N)
- Spezies Methanococcus sp. Mc85_2(N)
- Spezies Methanococcus sp. Ms33_19(N)
- Spezies Methanococcus sp. Ms33_20(N)
- Spezies Methanococcus sp. Ms55_19(N)
- Spezies Methanococcus sp. Ms55_20(N)
- Spezies Methanococcus sp. P2F9701a(N)
Verschiebungen nach LPSN:
- zur Gattung Methanocaldococcus:
- Methanococcus vulcanius Jeanthon et al. 1999
⇒ Methanocaldococcus vulcanius (Jeanthon et al. 1999) Whitman 2002 - Methanococcus fervens Jeanthon et al. 1999
⇒ Methanocaldococcus fervens (Jeanthon et al. 1999) Whitman 2002 - Methanococcus infernus Jeanthon et al. 1998
⇒ Methanocaldococcus infernus (Jeanthon et al. 1998) Whitman 2002 - Methanococcus jannaschii Jones et al. 1984
⇒ Methanocaldococcus jannaschii (Jones et al. 1984) Whitman 2002 - Methanococcus thermolithotrophicus Huber et al. 1984
⇒ Methanothermococcus thermolithotrophicus (Huber et al. 1984) Whitman 2002 - Methanococcus vulcanius Jeanthon et al. 1999
⇒ Methanocaldococcus vulcanius (Jeanthon et al. 1999) Whitman 2002
- Methanococcus vulcanius Jeanthon et al. 1999
- zur Gattung Methanosarcina:
- Methanococcus frisius Blotevogel et al. 1986
⇒ Methanosarcina mazei corrig. (Barker 1936) Mah & Kuhn 1984 - Methanococcus mazei Barker 1936
⇒ Methanosarcina mazei corrig. (Barker 1936) Mah & Kuhn 1984[6]
- Methanococcus frisius Blotevogel et al. 1986
- zur Gattung Methanohalophilus:
- Methanococcus halophilus Zhilina 1984
⇒ Methanohalophilus halophilus (Zhilina 1984) Wilharm et al. 1991
- Methanococcus halophilus Zhilina 1984
- zur Gattung Methanotorris:
- Methanococcus igneus Burggraf et al. 1990
⇒ Methanotorris igneus (Burggraf et al. 1990) Whitman 2002
- Methanococcus igneus Burggraf et al. 1990
Phylogenie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI).[3]
| 16S-rRNA-basiert: LTP_06_2022[10] | Basierend auf 53 Markerproteinen: GTDB 08-RS214[11] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Anmerkungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ Unter anderem wurde dabei die auch hyperthermophile Art M. jannaschii in die Gattung Methanocaldococcus verschoben. Diese Art wurde am Fuße eines „weißen Rauchers“ bei 21 °N auf dem Ostpazifischen Rücken entdeckt[7] und war das erste vollständig sequenzierte Genom eines Archaeons, das viele neue und eukaryotenähnliche Eigenschaften und Komponenten aufdeckte.[8]
Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b Albert Jan Kluyver, Cornelius Bernard van Niel: Prospects for a natural system of classification of bacteria. In: Zentralblatt für Bakterologie, Parasitenkunde, Infectinskrankheiten und Hygiene, Abteilung II. 94. Jahrgang. G. Fischer, Jena 22. Mai 1936, OCLC 14175991, CorpusID:88065481, S. 369–403 (englisch).
- ↑ a b c d e LPSN: Genus Methanococcus Kluyver and van Niel 1936 ….
- ↑ a b c NCBI Taxonomy Browser: Methanococcus, Details: Methanococcus Kluyver and van Niel 1936 emend. Barker 1936 …. Rank: genus.
- ↑ a b GTDB: Methanococcus.
- ↑ a b WoRMS: Methanococcus (Kluyver & van Niel, 1936) emend. Barker, 1936. Rank: Genus.
- ↑ a b c
Robert A. Mah, Daisy A. Kuhn: Transfer of the type species of the genus Methanococcus to the genus Methanosarcina naming it Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. nov. et emend. and conservation of the genus Methanococcus (Approved Lists, 1980) with Methanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) as the type species. Request for an opinion. In: International Journal of Systematc Bacteriology, Band 34, Nr. 2, 1. April 1984, S. 263–265; doi:10.1099/00207713-34-2-263 (englisch). Dazu:
- Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes: Opinion 62: Transfer of the type species of the genus Methanococcus to the genus Methanosarcina as Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. nov. et emend. Mah and Kuhn 1984 and conservation of the genus Methanococcus (Approved Lists, 1980) emend. Mah and Kuhn 1984 with Methanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) as the type species. In: International Journal of Systematic Bacteriology, Band 36, Nr. 3, 1. Juli 1986, S. 491; doi:10.1099/00207713-36-3-491 (englisch).
- ↑ W. J. Jones, J. A. Leigh, F. Mayer, Carl R. Woese, R. S. Wolfe: Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent. In: Archives of Microbiolology, Band 136, Nr. 4, Dezember 1983, S. 254–261; doi:10.1007/BF00425213, bibcode:1983ArMic.136..254J (englisch).
- ↑ Carol J. Bult, Owen White, J. Craig Venter et al.: Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii. In: Science, Band 273, Nr. 5278, August 1996, S. 1058–1073, doi:10.1126/science.273.5278.1058, PMID 8688087, bibcode:1996Sci...273.1058B (englisch).
- ↑ a b c d Thressa Campbell Stadtman, Horace Albert Barker: Studies on the methane fermentation. X. A new formate-decomposing bacterium, Methanococcus vannielii. In: Journal of Bacteriology, Band 62, Nr. 3, 1. September 1951, S. 269–280; doi:10.1128/jb.62.3.269-280.1951, PMC 386125 (freier Volltext), PMID 14888644 (englisch).
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project 06_2022
- About. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch).
- LTP_all tree in newick format. Abgerufen am 10. Mai 2023.
- Release Notes. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch).
- ↑ Genome Taxonomy Database (GTDB) 08-RS214
- About. In: GTDB. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch).
- Tree-Datei ar53_r214.sp_label. In: GTDB. Abgerufen am 10. Mai 2023.
- Taxon History. In: GTDB. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch).
Weiterführende Literatur
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes: The nomenclatural types of the orders Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales and Verrucomicrobiales are the genera Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus and Verrucomicrobium, respectively. Opinion 79. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 55, Nr. 1, 1. Januar 2005, S. 517–518; doi:10.1099/ijs.0.63548-0, PMID 15653928 (englisch).
- Christian Jeanthon, Stéphane L’Haridon, Nathalie Pradel, Daniel Prieur: Rapid identification of hyperthermophilic methanococci isolated from deep-sea hydrothermal vents. In: Intenationa Journa of Systematic and Evolutionary Microbiology. 49. Jahrgang, Nr. 2, 1. April 1999, S. 591–594, doi:10.1099/00207713-49-2-591, PMID 10319480 (englisch).
- Jyoti Keswani, S. Orkand, Usha Premachandran, L. Mandelco, M. J. Franklin, William B. Whitman: Phylogeny and taxonomy of mesophilic Methanococcus spp. and comparison of rRNA, DNA hybridization, and phenotypic methods. In: International Journal of Systematic Bacteriology. 46. Jahrgang, Nr. 3, 1. Juli 1996, S. 727–735, doi:10.1099/00207713-46-3-727, PMID 8782682 (englisch).
- Lawrence G. Wayne: Actions of the Judicial Commission of the International Committee on Systematic Bacteriology on requests for opinions published in 1983 and 1984. In: International Journal of Systematic Bacteriology. 36. Jahrgang, Nr. 2, 1. April 1986, S. 357–358, doi:10.1099/00207713-36-2-357 (englisch).
- William E. Balch, George E. Fox, Linda J. Magrum, Carl R. Woese, Ralph S. Wolfe: Methanogens: reevaluation of a unique biological group. In: Microbiology and Molecular Reviews. 43. Jahrgang, Nr. 2, 1. Juni 1979, S. 260–296, doi:10.1128/MMBR.43.2.260-296.1979, PMID 390357, PMC 281474 (freier Volltext) – (englisch).
- Kylie D. Allen, Gunter Wegener, Robert H. White: Discovery of Multiple Modified F430 Coenzymes in Methanogens and Anaerobic Methanotrophic Archaea Suggests Possible New Roles for F430 in Nature. In: Applied and Environmental Microbiology. 80. Jahrgang, Nr. 20, 8. August 2014, S. 6403–6412, doi:10.1128/AEM.02202-14, PMID 25107965, PMC 4178637 (freier Volltext), bibcode:2014ApEnM..80.6403A (englisch).
- Kyle C. Costa, Thomas J. Lie, Qin Xia, John A. Leigh: VhuD facilitates electron flow from H2 or formate to heterodisulfide reductase in Methanococcus maripaludis. In: Journal of Bacteriology, Band 195, Nr. 22, November 2013, S. 5160–5165; doi:10.1128/JB.00895-13, PMC 3811579 (freier Volltext), PMID 24039260, Epub 13. September 2013 (englisch).