PCID2

PCID2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3T5X
Ідентифікатори
Символи	PCID2, F10, PCI domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 613713 MGI: 2443003 HomoloGene: 10168 GeneCards: PCID2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • RNA binding Клітинна компонента • ядерна пора • transcription export complex 2 • компонент клітини • клітинне ядро • цитоплазма • nuclear pore nuclear basket Біологічний процес • positive regulation of B cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint • negative regulation of apoptotic process • spleen development • regulation of mRNA stability • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • poly(A)+ mRNA export from nucleus • protein transport • mRNA transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55795	234069
Ensembl	ENSG00000126226	ENSMUSG00000038542
UniProt	Q5JVF3	Q8BFV2
RefSeq (мРНК)	NM_001127202 NM_001127203 NM_001258212 NM_001258213 NM_018386 NM_001320655 NM_001320656 NM_001320657 NM_001320659 NM_001320660 NM_001353091 NM_001353092 NM_001353093 NM_001353094 NM_001353095	NM_178708
RefSeq (білок)	NP_001120674 NP_001120675 NP_001245142 NP_001307584 NP_001307585 NP_001307586 NP_001307588 NP_001307589 NP_060856 NP_001340020 NP_001340021 NP_001340022 NP_001340023 NP_001340024	NP_848823
Локус (UCSC)	Хр. 13: 113.18 – 113.21 Mb	Хр. 8: 13.13 – 13.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCID2 (англ. PCI domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 46 030.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHITINQYL		QQVYEAIDSR		DGASCAELVS		FKHPHVANPR		LQMASPEEKC
QQVLEPPYDE		MFAAHLRCTY		AVGNHDFIEA		YKCQTVIVQS		FLRAFQAHKE
ENWALPVMYA		VALDLRVFAN		NADQQLVKKG		KSKVGDMLEK		AAELLMSCFR
VCASDTRAGI		EDSKKWGMLF		LVNQLFKIYF		KINKLHLCKP		LIRAIDSSNL
KDDYSTAQRV		TYKYYVGRKA		MFDSDFKQAE		EYLSFAFEHC		HRSSQKNKRM
ILIYLLPVKM		LLGHMPTVEL		LKKYHLMQFA		EVTRAVSEGN		LLLLHEALAK
HEAFFIRCGI		FLILEKLKII		TYRNLFKKVY		LLLKTHQLSL		DAFLVALKFM
QVEDVDIDEV		QCILANLIYM		GHVKGYISHQ		HQKLVVSKQN		PFPPLSTVC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13