SCFD1

SCFD1
Ідентифікатори
Символи	SCFD1, C14orf163, RA410, SLY1, SLY1P, STXBP1L2, sec1 family domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 618207 MGI: 1924233 HomoloGene: 5650 GeneCards: SCFD1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • cis-Golgi network • клітинна мембрана • Golgi transport complex • Golgi-associated vesicle • Golgi cisterna membrane • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • negative regulation of autophagosome assembly • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • response to hypoxia • regulation of protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • toxin transport • post-Golgi vesicle-mediated transport • vesicle docking involved in exocytosis • COPII vesicle coating • GO:0000767 cell morphogenesis • protein transport • response to toxic substance • vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23256	76983
Ensembl	ENSG00000092108	ENSMUSG00000020952
UniProt	Q8WVM8	Q8BRF7
RefSeq (мРНК)	NM_001257376 NM_001283031 NM_001283032 NM_001283033 NM_016106 NM_182835	NM_029825 NM_001306178
RefSeq (білок)	NP_001244305 NP_001269960 NP_001269961 NP_001269962 NP_057190 NP_878255	NP_001293107 NP_084101
Локус (UCSC)	Хр. 14: 30.62 – 30.74 Mb	Хр. 12: 51.42 – 51.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCFD1 (англ. Sec1 family domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 642 амінокислот, а молекулярна маса — 72 380.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAAATAA		AAASIRERQT		VALKRMLNFN		VPHIKNSTGE		PVWKVLIYDR
FGQDIISPLL		SVKELRDMGI		TLHLLLHSDR		DPIPDVPAVY		FVMPTEENID
RMCQDLRNQL		YESYYLNFIS		AISRSKLEDI		ANAALAASAV		TQVAKVFDQY
LNFITLEDDM		FVLCNQNKEL		VSYRAINRPD		ITDTEMETVM		DTIVDSLFCF
FVTLGAVPII		RCSRGTAAEM		VAVKLDKKLR		ENLRDARNSL		FTGDTLGAGQ
FSFQRPLLVL		VDRNIDLATP		LHHTWTYQAL		VHDVLDFHLN		RVNLEESSGV
ENSPAGARPK		RKNKKSYDLT		PVDKFWQKHK		GSPFPEVAES		VQQELESYRA
QEDEVKRLKS		IMGLEGEDEG		AISMLSDNTA		KLTSAVSSLP		ELLEKKRLID
LHTNVATAVL		EHIKARKLDV		YFEYEEKIMS		KTTLDKSLLD		IISDPDAGTP
EDKMRLFLIY		YISTQQAPSE		ADLEQYKKAL		TDAGCNLNPL		QYIKQWKAFT
KMASAPASYG		STTTKPMGLL		SRVMNTGSQF		VMEGVKNLVL		KQQNLPVTRI
LDNLMEMKSN		PETDDYRYFD		PKMLRGNDSS		VPRNKNPFQE		AIVFVVGGGN
YIEYQNLVDY		IKGKQGKHIL		YGCSELFNAT		QFIKQLSQLG		QK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14