Альфа-актинін-4

Альфа-актинін-4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WLX, 1YDI, 2R0O
Ідентифікатори
Символи	ACTN4, ACTININ-4, FSGS, FSGS1, Actinin alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604638 MGI: 1890773 HomoloGene: 55857 GeneCards: ACTN4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв’язування з іоном металу; • calcium ion binding; • actin binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • protein N-terminus binding; • nucleoside binding; • transmembrane transporter binding; • nuclear receptor coactivator activity; • integrin binding; • retinoic acid receptor binding; • chromatin DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • actin filament binding; • RNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity;
Клітинна компонента	• екзосома; • extracellular region; • brush border; • Псевдоподія; • цитоплазма; • actin cytoskeleton; • міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • stress fiber; • cell-cell junction; • neuron projection; • focal adhesion; • platelet alpha granule lumen; • внутрішньоклітинний; • Z discdkac; • perinuclear region of cytoplasm; • cortical cytoskeleton; • міжклітинний простір; • гіалоплазма; • ядерні тільця; • цитоскелет; • GO:0009327 protein-containing complex; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• response to hypoxia; • vesicle transport along actin filament; • actin filament bundle assembly; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • regulation of apoptotic process; • positive regulation of cell migration; • bicellular tight junction assembly; • positive regulation of sodium:proton antiporter activity; • protein localization to bicellular tight junction; • platelet degranulation; • positive regulation of pinocytosis; • retinoic acid receptor signaling pathway; • regulation of nucleic acid-templated transcription; • protein transport; • peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway; • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • GO:0015915 транспорт; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	81
	60595
	ENSG00000130402; ENSG00000282844
	ENSMUSG00000054808
	O43707
	P57780
	NM_004924; NM_001322033
	NM_021895; NM_001360548; NM_001360549; NM_001360550
	NP_001308962; NP_004915
	NP_068695; NP_001347477; NP_001347478; NP_001347479
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Альфа-актинін-4 (англ. Actinin alpha 4) – білок, який кодується геном ACTN4, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 104 854^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDYHAANQS	YQYGPSSAGN	GAGGGGSMGD	YMAQEDDWDR	DLLLDPAWEK
QQRKTFTAWC	NSHLRKAGTQ	IENIDEDFRD	GLKLMLLLEV	ISGERLPKPE
RGKMRVHKIN	NVNKALDFIA	SKGVKLVSIG	AEEIVDGNAK	MTLGMIWTII
LRFAIQDISV	EETSAKEGLL	LWCQRKTAPY	KNVNVQNFHI	SWKDGLAFNA
LIHRHRPELI	EYDKLRKDDP	VTNLNNAFEV	AEKYLDIPKM	LDAEDIVNTA
RPDEKAIMTY	VSSFYHAFSG	AQKAETAANR	ICKVLAVNQE	NEHLMEDYEK
LASDLLEWIR	RTIPWLEDRV	PQKTIQEMQQ	KLEDFRDYRR	VHKPPKVQEK
CQLEINFNTL	QTKLRLSNRP	AFMPSEGKMV	SDINNGWQHL	EQAEKGYEEW
LLNEIRRLER	LDHLAEKFRQ	KASIHEAWTD	GKEAMLKHRD	YETATLSDIK
ALIRKHEAFE	SDLAAHQDRV	EQIAAIAQEL	NELDYYDSHN	VNTRCQKICD
QWDALGSLTH	SRREALEKTE	KQLEAIDQLH	LEYAKRAAPF	NNWMESAMED
LQDMFIVHTI	EEIEGLISAH	DQFKSTLPDA	DREREAILAI	HKEAQRIAES
NHIKLSGSNP	YTTVTPQIIN	SKWEKVQQLV	PKRDHALLEE	QSKQQSNEHL
RRQFASQANV	VGPWIQTKME	EIGRISIEMN	GTLEDQLSHL	KQYERSIVDY
KPNLDLLEQQ	HQLIQEALIF	DNKHTNYTME	HIRVGWEQLL	TTIARTINEV
ENQILTRDAK	GISQEQMQEF	RASFNHFDKD	HGGALGPEEF	KACLISLGYD
VENDRQGEAE	FNRIMSLVDP	NHSGLVTFQA	FIDFMSRETT	DTDTADQVIA
SFKVLAGDKN	FITAEELRRE	LPPDQAEYCI	ARMAPYQGPD	AVPGALDYKS
FSTALYGESD	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Patrie K.M., Drescher A.J., Welihinda A., Mundel P., Margolis B. (2002). Interaction of two actin-binding proteins, synaptopodin and alpha-actinin-4, with the tight junction protein MAGI-1. J. Biol. Chem. 277: 30183—30190. PMID 12042308 doi:10.1074/jbc.M203072200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:166 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43707 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:166 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O43707 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]