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Ras超家族

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H-RasPDB121p上的结构,颜色代表了Pfam宗系上的氨基酸保守性数据,金色:最保守;深青色:最不保守
标识符
符号Ras
蛋白质家族数据库(Pfam)PF00071
蛋白质互联数据库(InterPro)英语InterProIPR013753
蛋白质站点(PROSITE)英语PROSITEPDOC00017
蛋白质结构分类数据库2(SCOP2)英语Structural Classification of Proteins5p21 / SCOPe / SUPFAM
膜中蛋白质方向(OPM)蛋白质英语Orientations of Proteins in Membranes database1uad
保守域数据库(CDD)英语Conserved Domain Databasecd00882
可用的蛋白质结构:
蛋白质家族数据库(Pfam)  结构 / ECOD  
蛋白质数据库(PDB)RCSB PDB; PDBe; PDBj
蛋白质数据库总揽概括(PDBsum)英语PDBsum结构总揽
蛋白质数据库(PDB)2folA:13-174 1ukvY:10-171 1yznA:10-171

2bcgY:10-171 1g17B:22-182 1g16C:22-182 3rabA:24-185 1zbdA:24-185 2ew1A:11-172 1x3sA:10-171 1z0kA:10-171 2bmeA:10-171 2bmdA:10-171 1yu9A:10-171 2aedA:13-174 1z0fA:13-174 1z0aD:8-169 2a5jA:8-169 1oivB:13-172 1yzkA:13-174 1oixA:13-172 1oiwA:13-172 1z06A:35-201 1huqA:23-182 1z0dC:23-183 1z07A:23-182 1r2qA:22-183 1n6rA:22-183 1ek0A:9-173 1yvdA:7-168 1z0jA:7-168 2fg5A:7-168 1z08A:21-182 1yztB:21-182 1yzuB:21-182 1z0iA:21-182 1yzqA:15-176 1d5cA:13-172 1t91C:10-175 1vg8D:10-175 1vg9H:10-175 1vg1A:10-175 1vg0B:10-175 1ky3A:10-178 1ky2A:10-178 1yzlA:9-174 1wmsB:9-174 1s8fB:9-174 2f7sA:11-183 1z22A:11-171 1z2aA:11-171 1plj :5-165 1ctqA:5-165 1crp :5-165 821p :5-165 2eryB:16-177 2fn4A:31-192 1x1sA:15-177 1x1rA:15-177 1u90A:16-177 1u8zA:16-177 1u8yB:16-177 1uadB:16-177 2bovA:16-177 2a78A:16-177 3rapR:5-166 1kao :5-166 2rap :5-166 1c1yA:5-167 1guaA:5-167 1xtrA:8-169 1xtqA:8-169 1xtsA:8-169 2erxB:9-171 1a4rB:5-178 1kmqA:7-180 1tx4B:7-179 1cxzA:7-180 1m7bA:25-199 1gwnA:25-199 2bkuA:12-170 3ranA:12-170 1qg4B:12-170 1byuA:12-170

2atvA:8-169

Ras超家族(英語:Ras superfamily)是一个小GTP酶英语small GTPase蛋白质超家族,名称来自其中的Ras亚家族(在人类中为KRASNRASHRAS)。

Ras超家族中有超过100种蛋白质[1],根据其序列、结构和功能,可分为9个主要的家族,各自还可再分亚家族。这9个蛋白质家族为:RasRadRabRapRanRhoRhebRitArfMiro最近也被列入这个超家族中。

每个亚家族都有共同的G结构域核心,提供GTP酶与GTP/GDP交换活性。

周围序列有助于确定小GTP酶的功能特异性,例如Rho亚家族常见的“插入环”,特别有助于与效应蛋白如IQGAP和WASP(Wiskott–Aldrich syndrome protein)结合。

通常,Ras家族负责细胞增殖:Rho用于细胞形态,Ran用于核运输,Rab和Arf用于囊泡运输[2]

亚家族与其成员

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以下列表列出了人类蛋白质中Ras超家族的成员[1]

亚家族 功能 成员
Ras 细胞增殖 [2] DIRAS1; DIRAS2; DIRAS3; ERAS; GEM; HRAS; KRAS; MRAS; NKIRAS1; NKIRAS2; NRAS; RALA; RALB; RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C; RASD1; RASD2; RASL10A; RASL10B; RASL11A; RASL11B; RASL12; REM1; REM2; RERG; RERGL; RRAD; RRAS; RRAS2
Rho 细胞骨架的动力与形态[2] RHOA; RHOB; RHOBTB1; RHOBTB2; RHOBTB3; RHOC; RHOD; RHOF; RHOG; RHOH; RHOJ; RHOQ; RHOU; RHOV; RND1; RND2; RND3; RAC1; RAC2; RAC3; CDC42
Rab 膜转运 RAB1A; RAB1B; RAB2; RAB3A; RAB3B; RAB3C; RAB3D; RAB4A; RAB4B; RAB5A; RAB5B; RAB5C; RAB6A; RAB6B; RAB6C; RAB7A; RAB7B; RAB7L1; RAB8A; RAB8B; RAB9; RAB9B; RABL2A; RABL2B; RABL4; RAB10; RAB11A; RAB11B; RAB12; RAB13; RAB14; RAB15; RAB17; RAB18; RAB19; RAB20; RAB21; RAB22A; RAB23; RAB24; RAB25; RAB26; RAB27A; RAB27B; RAB28; RAB2B; RAB30; RAB31; RAB32; RAB33A; RAB33B; RAB34; RAB35; RAB36; RAB37; RAB38; RAB39; RAB39B; RAB40A; RAB40AL; RAB40B; RAB40C; RAB41; RAB42; RAB43
Rap 细胞粘附英语cell adhesion RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C
Arf 囊泡转运英语Vesicular transport protein[2] ARF1; ARF3; ARF4; ARF5; ARF6; ARL1; ARL2; ARL3; ARL4; ARL5; ARL5C; ARL6; ARL7; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11; ARL13A; ARL13B; ARL14; ARL15; ARL16; ARL17; TRIM23, ARL4D; ARFRP1; ARL13B
Ran 核運輸 RAN
Rheb mTOR途径 RHEB; RHEBL1
RGK RRAD; GEM; REM; REM2
Rit RIT1; RIT2
Miro 线粒体转运 RHOT1; RHOT2

未分类:

参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ. The Ras superfamily at a glance. J. Cell. Sci. March 2005, 118 (Pt 5): 843–6. PMID 15731001. doi:10.1242/jcs.01660. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P. Molecular cloning and experssion of a G25K cDNA, the human homolog of the yeast cell cycle gene CDC42. Mol Cell Biol. 1990, 10 (11): 5977–82. ISSN 0270-7306. PMC 361395可免费查阅. PMID 2122236.