芽孢桿菌門
芽孢杆菌门
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| 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） 革兰氏染色 | |
科学分类 
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| 域： | 细菌域 Bacteria |
| 界： | 芽孢杆菌界 Bacillati |
| 门： | 芽孢杆菌门 Bacillota Gibbons and Murray 2021[1] |
| 纲和地位未定[2] | |
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| 異名 | |
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芽孢杆菌门（学名：Bacillota），前称为厚壁菌门（学名：Firmicutes），[3]是细菌的一个门，大多数细菌为革兰氏阳性，具有细胞壁结构。[4] 它们有圆形细胞，称为球菌（单数球菌），或棒状形式（杆菌）。一些芽孢杆菌，例如来自阴性球菌纲的巨球形菌属、梳状菌属、月形单胞菌属和嗜发酵菌属，具有多孔的伪外膜，使它们染成革兰氏阴性。许多芽孢杆菌会产生内孢子，这种内孢子耐干燥并能在极端条件下生存。它们存在于各种环境中，该组包括一些值得注意的病原体。属于同一科的阳光杆菌芽孢杆菌通过不产氧光合作用 产生能量。芽孢杆菌在啤酒、葡萄酒和苹果酒的腐败中起着重要作用。
分类学
[编辑]2021年对厚壁菌门等门类的重新命名在微生物学家中仍然存在争议，其中许多人继续使用文献中长期存在的早期名称。[5] “厚壁菌门”（Firmicutes）一词源于拉丁语，意为“坚韧的皮肤”，指的是该门细菌特有的厚细胞壁。科学家曾将厚壁菌门归类为所有革兰氏阳性菌，但最近将其定义为一个核心相关菌群，称为低鸟嘌呤+胞嘧啶（G+C）含量组，与高G+C含量的放线菌门相对。
该菌群通常分为厌氧梭菌纲和专性需氧或选择性需氧芽孢杆菌纲。在系统发生树上，前两类菌群显示为并系群或多系群，它们的主要属：梭菌属和芽孢杆菌属亦如此。[6] 然而，一般认为芽孢杆菌门作为一个整体是单系的，或者除了柔膜菌纲之外是并系的，著名的柔膜菌纲的一个属即支原体，因其缺乏细胞壁而不能被革兰氏方法染色。[7]
进化
[编辑]一些人认为芽孢杆菌门是古菌的来源，[8]根据那里的模型，古菌从细菌分支出来相对较晚，而不是从细胞生命的最后共同祖先（last universal common ancestor，缩写：LUCA）形成独立起源的早期谱系（生命领域）。
系统发育
[编辑]目前接受的分类法基于原核生物标准命名列表（LPSN）[9]和美国国家生物技术信息中心（NCBI）。[10]
| 基于16S rRNA LTP_01_2022[11][12][13] | GTDB 08-RS214 基因组分类学数据库[14][15][16] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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下属
[编辑]截至2016年[update]，超过274个属被认为属于芽孢杆菌门，芽孢杆菌门的重要属包括：
- 丹毒丝菌属（Erysipelothrix）
临床意义
[编辑]芽孢杆菌门占人类胃肠道菌群的11%—95%。[17]作为肠道菌群的一部分，芽孢杆菌门已被证明参与能量吸收，并可能与糖尿病和肥胖症的发展有关。[18][19][20][21] 在健康成年人的肠道中，数量最多的细菌是普氏栖粪杆菌，占肠道菌群总量的5%，属于芽孢杆菌门。该菌种与肥胖症中低度炎症的减轻直接相关。[22] 研究发现，肥胖儿童肠道中的普氏栖粪杆菌含量高于非肥胖儿童。
多项研究发现，肥胖个体的芽孢杆菌数量高于体型较瘦的对照组。肥胖患者的乳酸杆菌（属于芽孢杆菌门）含量较高，其中一项研究发现，进行减肥饮食的肥胖患者肠道内的芽孢杆菌数量有所减少。[23]
研究还表明，小鼠饮食的变化会促进芽孢杆菌丰度的变化。饲喂西方饮食（高脂肪/高糖）的小鼠的芽孢杆菌相对丰度高于饲喂标准低脂肪/高多糖饮食的小鼠。芽孢杆菌含量的增加也与小鼠肥胖和体重增加有关。[24] 具体来说，在肥胖小鼠中，柔膜菌纲（属芽孢杆菌门）最为常见。当将芽孢杆菌门丰度较高的肥胖小鼠的肠道菌群移植到无菌小鼠的肠道中时，与移植了芽孢杆菌门丰度较低的瘦小鼠的肠道菌群的相比，无菌小鼠的脂肪显著增加。[25]
研究发现，从人类粪便中分离出的克里斯滕森氏菌属（芽孢杆菌门，属于梭菌纲）的存在与较低的身体质量指数相关。[26]
参阅
[编辑]参考文献
[编辑]- ^ Oren A, Garrity GM. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. Int J Syst Evol Microbiol. 2021, 71 (10): 5056. PMID 34694987. S2CID 239887308. doi:10.1099/ijsem.0.005056
.
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- ^ 存档副本. [2022-04-23]. （原始内容存档于2022-06-01）.
- ^ 道兰氏医学词典中的Firmicutes
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外部链接
[编辑]- 厚壁菌门—J.P. Euzéby：原核生物标准命名列表